Історія створення Житомирського прикордонного загону починається 2001 року.
Історія створення Житомирського прикордонного загону починається з часу коли на виконання Указу Президента України від 18.01.2001 року № 22/2001 «Про заходи щодо посилення боротьби з незаконною міграцією» Головою Державного комітету у справах охорони державного кордону була підписана Директива від 20 червня 2001 року № 075 «Про створення Житомирського прикордонного загону, як органу охорони державного кордону Прикордонних військ України з місцем дислокації м. Житомир».
Організацію роботи щодо формування органу охорони державного кордону було покладено на Командувача військ Північно-Західного напряму Прикордонних військ України генерал-лейтенанта Миколу Йолтуховського, який 20 липня 2001 року затвердив “План формування військової частини 1495».
Місцем розташування управління військової частини в Житомирі було обрано корпуси і прилегла територія науково-дослідного Інституту хмелярства та дитячий садок Інституту сільського господарства «Полісся».
Основним кадровим ядром для формування управління та підрозділів прикордонного загону став особовий склад військових частин Північно-Західного напряму Прикордонних військ України.
Так, на виконання розпорядження Держкомітету в липні 2001 року до місця дислокації управління прикордонного загону прибули перші офіцери, формуючи управління прикордонного загону.
Для розгортання нових прикордонних підрозділів в Київській області, а саме – прикордонної комендатури в м. Іванків, прикордонних застав в с. Оране, с. Млачівка, було направлено військовослужбовців спеціальної прикордонної комендатури «Овруч» Луцького прикордонного загону, яка з вересня 1992 року здійснювала охорону українсько-білоруської ділянки державного кордону на території Житомирської та Київської областей. Та вже 30 жовтня 2001 року зазначений підрозділ було передано у підпорядкування Житомирського прикордонного загону.
1 листопада 2001 року загін приступив до охорони державного кордону у складі двох прикордонних комендатур “Іванків” та “Овруч” загальною протяжністю кордону близько 416 кілометрів в межах Київської та Житомирської областей.
2 листопада 2002 року в урочистій обстановці Голова Держкомкордону вручив прикордонному загону Бойовий прапор.
У грудні 2002 року комісія на чолі з командувачем Північного напряму прикордонних військ України здійснила прийом-передачу прикордонного загону, який з січня 2003 року ввійшов до штату Північного напряму в подальшому Північного регіонального управління.
З початком неоголошеної війни на сході держави, Житомирський прикордонний загін один з перших був залучений до комплектування та забезпечення оперативно-бойових підрозділів Державної прикордонної служби України для виконання завдань із захисту і оборони незалежності та територіальної цілісності України в межах Луганської та Донецької областей.
Всього у антитерористичній операції та Операції об’єднаних сил прийняло участь майже 75% персоналу прикордонного загону.
З метою приведення управлінської структури до загальноєвропейських стандартів, а також її оптимізації та запровадження співвідношення начальницького та рядового складу відповідно до стандартів НАТО, в грудні 2019 року загін став органом охорони державного кордону центрального підпорядкування.
На сьогодні охорону державного кордону в межах ділянки відповідальності Житомирського прикордонного загону здійснюють п’ять відділів прикордонної служби: «Іванків», «Млачівка», «Овруч», «Ясинець» та «Копище». Також загін має спеціальний підрозділ – відділ прикордонної служби типу “C” та прикордонну комендатуру швидкого реагування.
Житомирський прикордонний загін займає гідне місце у виконанні завдань по забезпеченню недоторканності державного кордону в системі Державної прикордонної служби України.
